Sageretia con problemas

Hola a todos. Aquí una novatilla en el tema de los bonsais   
Tengo un Sageteria theezans que tenía 3 años cuando lo compramos hace 1.
El caso es que ha empezado a ponerse negro por la zona de las raíces. Las hojas y las ramas no tienen mal aspecto.
Creemos que se está pudriendo   , pero no sabemos muy bien si es salvable o puede ser otra cosa.
¿Una ayudita?
Editado: vimos por alguna parte que si rascábamos la corteza y debajo estaba negra, no tenía salvación. Pero hemos rascado y debajo hay madera sana, tanto en tronco como en raíces.
Adjunto varias fotos.