Sobre el sustrato, es un tema muy amplio, yo te digo lo que uso yo.
En mi caso, pongo una capa de arlita, mucha gente usa volcanica, y otras akadama de grano grueso. La cosa es un sustrato granulado para que el arbol drene bien.
Y luego como sustrato uso akadama sola. No mezclo con ningun otro sustrato.
Sobre las raices, a la hora de transplantar un arbol, se deben de cortar aquellas raices gordas, dejando el mayor numero de raices finas. Y como tu dices, se deben de cortar aquellas que van hacia abajo, como tb las que van hacia arriba. Lo ideal es conseguir que todas las raices salgan radialmente.
Saludos
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Saludos